Podstatou architektonického řešení stavby jsou velké vzdušné prostory, což je z hlediska požární ochrany značně problematické. Hrozí nebezpečí rychlého zakouření prostor, které by mohlo vést k intoxikaci zplodinami hoření a ke ztrátě orientace návštěvníků. Zhodnocením všech rizik zde byly instalovány automatické svinovací rolety, které v případě vzniku požáru rozdělují prostor na kouřové sekce a minimalizují tak možné ohrožení osob kouřem. i díky tomu se podařilo vytvořit požární úsek o celkové ploše 13 919 m2 V budově NTK jsou navrženy dva systémy požárního odvětrání – přirozené prostřednictvím střešních klapek v atriu a nucené pomocí šachet. Účinnost a koordinace těchto zařízení byla výsledkem dlouholetých zkušeností projektantů požárního větrání.
